MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 chromosome

Total Repeats: 100745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014171	A	7	7	329	335	100 %	0 %	0 %	0 %	296500839
2	NC_014171	AAGC	2	8	339	346	50 %	0 %	25 %	25 %	296500839
3	NC_014171	GAA	2	6	390	395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500839
4	NC_014171	GAAT	2	8	420	427	50 %	25 %	25 %	0 %	296500839
5	NC_014171	TAT	2	6	516	521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500839
6	NC_014171	GAT	2	6	583	588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500839
7	NC_014171	TAGCTG	2	12	683	694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296500839
8	NC_014171	TTTA	2	8	724	731	25 %	75 %	0 %	0 %	296500839
9	NC_014171	ATC	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296500839
10	NC_014171	TTA	2	6	848	853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500839
11	NC_014171	ATA	2	6	866	871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296500839
12	NC_014171	TAA	2	6	888	893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296500839
13	NC_014171	GAT	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500839
14	NC_014171	AAG	2	6	959	964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500839
15	NC_014171	GAA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500839
16	NC_014171	GACC	2	8	1024	1031	25 %	0 %	25 %	50 %	296500839
17	NC_014171	AGA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500839
18	NC_014171	TTA	2	6	1088	1093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500839
19	NC_014171	CGC	2	6	1103	1108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296500839
20	NC_014171	A	6	6	1141	1146	100 %	0 %	0 %	0 %	296500839
21	NC_014171	CAAAT	2	10	1196	1205	60 %	20 %	0 %	20 %	296500839
22	NC_014171	TAAT	2	8	1265	1272	50 %	50 %	0 %	0 %	296500839
23	NC_014171	AGC	2	6	1293	1298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296500839
24	NC_014171	ATT	2	6	1315	1320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500839
25	NC_014171	AGA	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500839
26	NC_014171	A	6	6	1411	1416	100 %	0 %	0 %	0 %	296500839
27	NC_014171	CG	3	6	1463	1468	0 %	0 %	50 %	50 %	296500839
28	NC_014171	GAA	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500839
29	NC_014171	TGG	2	6	1509	1514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296500839
30	NC_014171	ACA	2	6	1525	1530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296500839
31	NC_014171	A	6	6	1547	1552	100 %	0 %	0 %	0 %	296500839
32	NC_014171	ACT	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296500839
33	NC_014171	GAA	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500839
34	NC_014171	AGT	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500839
35	NC_014171	TACAA	2	10	1810	1819	60 %	20 %	0 %	20 %	296500840
36	NC_014171	TCT	2	6	1865	1870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296500840
37	NC_014171	ACA	2	6	1874	1879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296500840
38	NC_014171	GAA	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500840
39	NC_014171	GAA	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500840
40	NC_014171	A	7	7	2059	2065	100 %	0 %	0 %	0 %	296500840
41	NC_014171	AAAAT	2	10	2114	2123	80 %	20 %	0 %	0 %	296500840
42	NC_014171	GAA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500840
43	NC_014171	CAT	2	6	2195	2200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296500840
44	NC_014171	TA	3	6	2307	2312	50 %	50 %	0 %	0 %	296500840
45	NC_014171	TGT	2	6	2410	2415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296500840
46	NC_014171	GAA	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500840
47	NC_014171	TTA	2	6	2484	2489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500840
48	NC_014171	TAT	2	6	2502	2507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500840
49	NC_014171	TAT	2	6	2523	2528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500840
50	NC_014171	TCT	2	6	2529	2534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296500840
51	NC_014171	AG	3	6	2584	2589	50 %	0 %	50 %	0 %	296500840
52	NC_014171	GTT	2	6	2675	2680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296500840
53	NC_014171	TTC	2	6	2716	2721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296500840
54	NC_014171	GTT	2	6	2744	2749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296500840
55	NC_014171	GAA	2	6	2750	2755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500840
56	NC_014171	AT	3	6	2809	2814	50 %	50 %	0 %	0 %	296500840
57	NC_014171	GATG	2	8	2815	2822	25 %	25 %	50 %	0 %	296500840
58	NC_014171	ATG	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500840
59	NC_014171	ATT	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500840
60	NC_014171	AATT	2	8	2919	2926	50 %	50 %	0 %	0 %	296500840
61	NC_014171	TACT	2	8	2938	2945	25 %	50 %	0 %	25 %	296500840
62	NC_014171	AAC	2	6	3195	3200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296500841
63	NC_014171	AGA	2	6	3213	3218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500841
64	NC_014171	ATG	2	6	3238	3243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500841
65	NC_014171	A	6	6	3323	3328	100 %	0 %	0 %	0 %	296500842
66	NC_014171	A	6	6	3523	3528	100 %	0 %	0 %	0 %	296500842
67	NC_014171	TCTTTG	2	12	3537	3548	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296500842
68	NC_014171	A	6	6	3564	3569	100 %	0 %	0 %	0 %	296500842
69	NC_014171	AAC	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296500842
70	NC_014171	AT	3	6	3617	3622	50 %	50 %	0 %	0 %	296500842
71	NC_014171	TGA	2	6	3628	3633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500842
72	NC_014171	AGA	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500842
73	NC_014171	AAG	2	6	3689	3694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500842
74	NC_014171	TTG	2	6	3786	3791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296500842
75	NC_014171	A	7	7	3792	3798	100 %	0 %	0 %	0 %	296500842
76	NC_014171	AGA	2	6	3953	3958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500842
77	NC_014171	AAG	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500842
78	NC_014171	AAC	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296500842
79	NC_014171	TTC	2	6	4113	4118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296500842
80	NC_014171	ACA	2	6	4157	4162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296500842
81	NC_014171	ACGA	2	8	4163	4170	50 %	0 %	25 %	25 %	296500842
82	NC_014171	ATTGA	2	10	4197	4206	40 %	40 %	20 %	0 %	296500842
83	NC_014171	GAT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500842
84	NC_014171	GAT	2	6	4266	4271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500842
85	NC_014171	ACG	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296500842
86	NC_014171	AAG	2	6	4366	4371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500842
87	NC_014171	AACG	2	8	4388	4395	50 %	0 %	25 %	25 %	296500842
88	NC_014171	ATAG	2	8	4413	4420	50 %	25 %	25 %	0 %	296500842
89	NC_014171	ATG	2	6	4497	4502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500843
90	NC_014171	GTAT	2	8	4554	4561	25 %	50 %	25 %	0 %	296500843
91	NC_014171	ATA	2	6	4614	4619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296500843
92	NC_014171	TGA	2	6	4624	4629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500843
93	NC_014171	TGA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500843
94	NC_014171	GAA	2	6	4670	4675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500843
95	NC_014171	ATA	2	6	4677	4682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296500843
96	NC_014171	A	6	6	4731	4736	100 %	0 %	0 %	0 %	296500843
97	NC_014171	TTA	2	6	4758	4763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500843
98	NC_014171	GGT	2	6	4781	4786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296500843
99	NC_014171	TGGCGG	2	12	4792	4803	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296500843
100	NC_014171	TGG	2	6	4816	4821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296500843
101	NC_014171	ACA	2	6	5015	5020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296500843
102	NC_014171	ATTAA	2	10	5081	5090	60 %	40 %	0 %	0 %	296500843
103	NC_014171	AGAA	2	8	5121	5128	75 %	0 %	25 %	0 %	296500843
104	NC_014171	AAC	2	6	5181	5186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296500843
105	NC_014171	ATA	2	6	5274	5279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296500843
106	NC_014171	GGT	2	6	5315	5320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296500843
107	NC_014171	AGGT	2	8	5328	5335	25 %	25 %	50 %	0 %	296500843
108	NC_014171	ATCA	2	8	5452	5459	50 %	25 %	0 %	25 %	296500843
109	NC_014171	TGCACG	2	12	5617	5628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296500843
110	NC_014171	A	6	6	5639	5644	100 %	0 %	0 %	0 %	296500843
111	NC_014171	ATT	2	6	5831	5836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500843
112	NC_014171	GC	3	6	5849	5854	0 %	0 %	50 %	50 %	296500843
113	NC_014171	ATG	2	6	5874	5879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500843
114	NC_014171	ATT	2	6	5891	5896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500843
115	NC_014171	TGG	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296500843
116	NC_014171	TTA	3	9	5958	5966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500843
117	NC_014171	CCGATG	2	12	5970	5981	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296500843
118	NC_014171	TAT	2	6	6006	6011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500843
119	NC_014171	TTC	2	6	6017	6022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296500843
120	NC_014171	AAT	2	6	6040	6045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296500843
121	NC_014171	GCC	2	6	6073	6078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296500843
122	NC_014171	ACA	2	6	6091	6096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296500843
123	NC_014171	A	7	7	6101	6107	100 %	0 %	0 %	0 %	296500843
124	NC_014171	A	6	6	6138	6143	100 %	0 %	0 %	0 %	296500843
125	NC_014171	CCAGC	2	10	6158	6167	20 %	0 %	20 %	60 %	296500843
126	NC_014171	GAC	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296500843
127	NC_014171	CGTT	2	8	6251	6258	0 %	50 %	25 %	25 %	296500843
128	NC_014171	CGT	2	6	6335	6340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296500843
129	NC_014171	GAA	2	6	6370	6375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500843
130	NC_014171	CAA	3	9	6489	6497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296500844
131	NC_014171	ATGA	2	8	6636	6643	50 %	25 %	25 %	0 %	296500844
132	NC_014171	CAG	3	9	6829	6837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296500844
133	NC_014171	A	6	6	6899	6904	100 %	0 %	0 %	0 %	296500844
134	NC_014171	ATG	2	6	6928	6933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500844
135	NC_014171	TAC	2	6	6955	6960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296500844
136	NC_014171	TTA	2	6	6978	6983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500844
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141	NC_014171	GAA	2	6	7156	7161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500844
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143	NC_014171	TAA	2	6	7283	7288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296500844
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169	NC_014171	GTTC	2	8	8511	8518	0 %	50 %	25 %	25 %	296500844
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258	NC_014171	A	6	6	17810	17815	100 %	0 %	0 %	0 %	296500847
259	NC_014171	GAACTG	2	12	17851	17862	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296500847
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262	NC_014171	TTA	2	6	17988	17993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296500847
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264	NC_014171	AAG	2	6	18029	18034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296500847
265	NC_014171	A	6	6	18080	18085	100 %	0 %	0 %	0 %	296500847
266	NC_014171	TTC	2	6	18088	18093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296500847
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389	NC_014171	T	7	7	24413	24419	0 %	100 %	0 %	0 %	296500854
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